Первые упоминания о протравливании относятся к Древнему Египту в 2100-1900 годах до н.э. Жрецы обрабатывали семена лука и чеснока отваром из навоза и мочи быков. Это позволяло защитить растения от некоторых вредителей.
В средневековой Европе XII-XIV веков для протравливания использовали отвары и настои из трав, коры деревьев, птичьего помёта. Также применяли золу, соль, мочевину. Насколько такие средства были эффективны - неизвестно.
Первые химические протравители на основе соединений ртути, мышьяка, меди появились в Европе в 1920-30х годах. Но они были ядовиты для людей и животных.
В США в 1941 году запатентовали первый безопасный протравитель - New Improved Ceresan на основе этилен-бис-дитиокарбамата цинка. Он хорошо защищал семена кукурузы от грибков. В 1960-е происходит бум синтеза новых фунгицидов с широким спектром действия.